Amik Ovası'nın tarıma kazandırılması, bölgenin ekonomik yapısını değiştirmiş ve tarımsal üretkenliği artırmış olsa da, bu süreç beraberinde ciddi çevresel sorunları da getirmiştir. Tarıma açılan alanlar, doğal yaşam alanlarının yok olmasına yol açarak ekosistem dengesini sarsmıştır. Bu durum, yerel fauna ve flora açısından riskler oluşturmakta ve sürdürülebilir tarım uygulamalarını zorlaştırmaktadır.

Amik Ovası'nın tarıma açılması, zirai verimi yüksek toprakların çiftçilere dağıtılması ve bölgenin tarımsal üretim merkezi haline gelmesi gibi olumlu sonuçlar doğurmuştur. Ancak bu durumun bazı olumsuz sonuçları da olmuştur:

• Ekolojik dengenin bozulması. Kurutma işlemi, bölgedeki kuşların yaşam alanını kaybetmesine ve her yıl yaşanan sel baskınlarına neden olmuştur.
• Kuraklık riskinin artması. Amik Gölü'nün kurutulması, Hatay'da yaşanan kuraklığın nedenlerinden biri olarak görülmektedir.